Археолог, доктор исторических наук, профессор. Ученик В.А. Городцова. С 1949 г.  – сотрудник ИИМК АН СССР / ИА РАН,  1956–1961 – ученый секретарь Института, зав. отделом бронзового века (1973–1988), зав. группой зарубежной археологии (1961–1980, 1989–2006), с 2006 г. – главный научный сотрудник. Член ученого совета ИА РАН, член редакционного совета журнала «Российская археология». Заслуженный деятель науки РФ, чл.-корр. Германского археологического института. Лауреат Государственной премии РФ в области наук и техники (1999). Участник Великой Отечественной войны.  Награжден орденом Великой Отечественной войны II степени и медалями, а также болгарскими орденами. Научные интересы: археология энеолита и бронзового века Восточной Европы, Балканского п-ова, Кавказа и Ближнего Востока, степной полосы Евразии эпохи бронзы и средневековья.

Мерперт Н.Я. Древнейшие скотоводы Волго-Уральского междуречья. М.: Наука, 1974. 173 с.

Энеолит СССР / Отв. ред. В.М. Массон, Н.Я. Мерперт. М.: Наука, 1982. 360 с. (Археология СССР)

Мерперт Н.Я. Очерки археологии библейских стран. М.: ББИ, 2000. 355 с.

Мунчаев Р.М., Мерперт Н.Я., Амиров Ш.Н. Телль Хазна I: Культово-административный центр в северо-восточной Сирии. Том I. М.: Палеограф, 2004. 488 с. 

Мерперт Н.Я. Из прошлого: далекого и близкого. Мемуары археолога. М.: ТАУС, 2011. 384 с., ил.

Древние культуры Юго-Восточной Европы и Западной Азии. Сборник к 90‑летию со дня рождения и памяти Н.Я. Мерперта / Отв. ред. Р.М. Мунчаев. М.: ИА РАН, 2014. 392 с.

Мунчаев Р.М. Николай Яковлевич Мерперт / В кн.: Институт археологии РАН: 100 лет истории.  М.: ИА РАН, 2019.  С. 269–271.